Дмитрий Чеботарев родился в Краснодаре. С 5 лет начал заниматься в городской «Академии футбола». В 2010 году перешел в систему резерва ФК «Краснодар». После шести лет обучения в «Краснодаре» пополнил команду Резерва футбольного клуба «Кубань» 2000 года рождения.